Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC173Q0VFZ6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC173Q0VFZ6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms