Protein–RNA interactions for Protein: Q08ER8

ZNF543, Zinc finger protein 543, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF543Q08ER8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF543Q08ER8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF543Q08ER8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms