Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
C2orf54Q08AI8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
C2orf54Q08AI8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C2orf54Q08AI8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms