Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SLFN5Q08AF3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLFN5Q08AF3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SLFN5Q08AF3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms