Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PUDPQ08623 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PUDPQ08623 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms