Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CYP4F3Q08477 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CYP4F3Q08477 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms