Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CACNB2Q08289 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNB2Q08289 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNB2Q08289 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms