Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SCN1BQ07699 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCN1BQ07699 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms