Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SOX4Q06945 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SOX4Q06945 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms