Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSTF1Q05048 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CSTF1Q05048 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms