Protein–RNA interactions for Protein: Q04182

PDR15, ATP-dependent permease PDR15, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PDR15Q04182 PEX7YDR142C 1128 nt5.03□□□□□ -1.6
PDR15Q04182 YHR180WYHR180W 492 nt5.03□□□□□ -1.6
PDR15Q04182 CHL4YDR254W 1377 nt5.03□□□□□ -1.6
PDR15Q04182 DIP2YLR129W 2832 nt5.03□□□□□ -1.6
PDR15Q04182 NAM2YLR382C 2685 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 SUB2YDL084W 1341 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 MDM1YML104C 3384 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 UBA2YDR390C 1911 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 ELM1YKL048C 1923 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 COA4YLR218C 453 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 VHC1YBR235W 3363 nt5.02□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 YDR444WYDR444W 2064 nt5.01□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 SOP4YJL192C 705 nt5.01□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 NIP7YPL211W 546 nt5.01□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 SUE1YPR151C 621 nt5.01□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 COX23YHR116W 456 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 AUR1YKL004W 1206 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 CWC27YPL064C 906 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 TAF8YML114C 1533 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 MET10YFR030W 3108 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 THI20YOL055C 1656 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 IMD4YML056C 1575 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 TRM1YDR120C 1713 nt4.99□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 YFL052WYFL052W 1398 nt4.98□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 RPS8BYER102W 603 nt4.98□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 RPS8AYBL072C 603 nt4.98□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 MED4YOR174W 855 nt4.98□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 SLI1YGR212W 1407 nt4.98□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 GRC3YLL035W 1899 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 NAT3YPR131C 588 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 MDM12YOL009C 816 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 YPL113CYPL113C 1191 nt4.97□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 POL3YDL102W 3294 nt4.96□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 YKL050CYKL050C 2769 nt4.96□□□□□ -1.61
PDR15Q04182 FAA3YIL009W 2085 nt4.96□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 HCA4YJL033W 2313 nt4.96□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 VAC7YNL054W 3498 nt4.96□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 SEC53YFL045C 765 nt4.96□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 RAI1YGL246C 1164 nt4.96□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 YML020WYML020W 1995 nt4.95□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 PRP9YDL030W 1593 nt4.95□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 NUP60YAR002W 1620 nt4.95□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 STR2YJR130C 1920 nt4.95□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 AVT7YIL088C 1473 nt4.95□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 MRH1YDR033W 963 nt4.95□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 PAN5YHR063C 1140 nt4.95□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 USB1YLR132C 873 nt4.95□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 PRP40YKL012W 1752 nt4.95□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 YPL216WYPL216W 3309 nt4.94□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 TAF7YMR227C 1773 nt4.94□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 TRP4YDR354W 1143 nt4.94□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 NKP1YDR383C 717 nt4.94□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 YJL175WYJL175W 513 nt4.94□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 YNL320WYNL320W 855 nt4.94□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 EMP70YLR083C 2004 nt4.94□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 YMR317WYMR317W 3423 nt4.94□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 CMR1YDL156W 1569 nt4.93□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 YGR107WYGR107W 450 nt4.93□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 BIO2YGR286C 1128 nt4.93□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 RPL15AYLR029C 615 nt4.93□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 YPK9YOR291W 4419 nt4.93□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 YNL247WYNL247W 2304 nt4.93□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 IFM1YOL023W 2031 nt4.93□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 OSH3YHR073W 2991 nt4.93□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 DRS2YAL026C 4068 nt4.93□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 MRPL16YBL038W 699 nt4.92□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 GOT1YMR292W 417 nt4.92□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 TPM1YNL079C 600 nt4.92□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 ASN1YPR145W 1719 nt4.92□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 SLN1YIL147C 3663 nt4.92□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 CDC26YFR036W 375 nt4.92□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 YIL054WYIL054W 318 nt4.92□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 RIM9YMR063W 720 nt4.92□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 SEC18YBR080C 2277 nt4.92□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 MYO5YMR109W 3660 nt4.91□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 ECM21YBL101C 3354 nt4.91□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 NOP4YPL043W 2058 nt4.91□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 HOT1YMR172W 2160 nt4.91□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 PCA1YBR295W 3651 nt4.91□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 EMW1YNL313C 2715 nt4.91□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 MRP13YGR084C 1020 nt4.91□□□□□ -1.62
PDR15Q04182 PEA2YER149C 1263 nt4.9□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 COS8YHL048W 1146 nt4.9□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 MAK16YAL025C 921 nt4.9□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 WRS1YOL097C 1299 nt4.9□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 TIR2YOR010C 756 nt4.9□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 THR4YCR053W 1545 nt4.89□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 OMS1YDR316W 1416 nt4.89□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 YHL049CYHL049C 816 nt4.89□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 HOM3YER052C 1584 nt4.89□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt4.88□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt4.88□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt4.88□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt4.88□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt4.88□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt4.88□□□□□ -1.63
PDR15Q04182 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 63 ms