Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NUCB1Q02818 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NUCB1Q02818 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms