Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SP4Q02446 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP4Q02446 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP4Q02446 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SP4Q02446 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SP4Q02446 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP4Q02446 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP4Q02446 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SP4Q02446 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP4Q02446 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP4Q02446 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP4Q02446 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SP4Q02446 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP4Q02446 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP4Q02446 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SP4Q02446 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP4Q02446 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP4Q02446 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP4Q02446 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP4Q02446 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP4Q02446 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP4Q02446 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP4Q02446 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SP4Q02446 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP4Q02446 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP4Q02446 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP4Q02446 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP4Q02446 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP4Q02446 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP4Q02446 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SP4Q02446 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP4Q02446 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SP4Q02446 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP4Q02446 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SP4Q02446 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP4Q02446 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP4Q02446 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP4Q02446 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP4Q02446 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP4Q02446 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP4Q02446 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP4Q02446 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SP4Q02446 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP4Q02446 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP4Q02446 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP4Q02446 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP4Q02446 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP4Q02446 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP4Q02446 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SP4Q02446 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SP4Q02446 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SP4Q02446 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SP4Q02446 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP4Q02446 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP4Q02446 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP4Q02446 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP4Q02446 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP4Q02446 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP4Q02446 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP4Q02446 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP4Q02446 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP4Q02446 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP4Q02446 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SP4Q02446 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP4Q02446 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP4Q02446 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP4Q02446 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP4Q02446 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP4Q02446 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP4Q02446 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP4Q02446 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP4Q02446 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP4Q02446 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP4Q02446 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SP4Q02446 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SP4Q02446 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SP4Q02446 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP4Q02446 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP4Q02446 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SP4Q02446 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SP4Q02446 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP4Q02446 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP4Q02446 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SP4Q02446 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SP4Q02446 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms