Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CDR2Q01850 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDR2Q01850 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDR2Q01850 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms