Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CACNA1BQ00975 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CACNA1BQ00975 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms