Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HSF1Q00613 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HSF1Q00613 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms