Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CDK17Q00537 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDK17Q00537 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms