Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PITPNAQ00169 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PITPNAQ00169 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PITPNAQ00169 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms