Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

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Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKD1P98161 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKD1P98161 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKD1P98161 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKD1P98161 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKD1P98161 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKD1P98161 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PKD1P98161 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PKD1P98161 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKD1P98161 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PKD1P98161 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKD1P98161 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKD1P98161 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKD1P98161 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKD1P98161 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKD1P98161 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKD1P98161 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PKD1P98161 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKD1P98161 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PKD1P98161 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKD1P98161 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKD1P98161 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKD1P98161 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKD1P98161 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKD1P98161 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKD1P98161 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKD1P98161 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKD1P98161 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKD1P98161 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PKD1P98161 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKD1P98161 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKD1P98161 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKD1P98161 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKD1P98161 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKD1P98161 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKD1P98161 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKD1P98161 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PKD1P98161 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PKD1P98161 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKD1P98161 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKD1P98161 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKD1P98161 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKD1P98161 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PKD1P98161 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKD1P98161 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKD1P98161 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKD1P98161 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PKD1P98161 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PKD1P98161 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PKD1P98161 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKD1P98161 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PKD1P98161 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKD1P98161 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKD1P98161 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKD1P98161 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKD1P98161 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKD1P98161 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKD1P98161 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKD1P98161 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKD1P98161 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKD1P98161 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKD1P98161 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PKD1P98161 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKD1P98161 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKD1P98161 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKD1P98161 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKD1P98161 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKD1P98161 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKD1P98161 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKD1P98161 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKD1P98161 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PKD1P98161 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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