Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFI35P80217 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFI35P80217 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFI35P80217 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFI35P80217 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFI35P80217 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
IFI35P80217 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFI35P80217 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
IFI35P80217 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
IFI35P80217 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFI35P80217 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFI35P80217 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFI35P80217 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFI35P80217 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFI35P80217 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
IFI35P80217 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFI35P80217 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFI35P80217 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFI35P80217 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFI35P80217 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFI35P80217 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFI35P80217 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFI35P80217 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFI35P80217 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFI35P80217 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFI35P80217 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFI35P80217 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFI35P80217 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFI35P80217 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFI35P80217 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFI35P80217 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFI35P80217 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFI35P80217 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFI35P80217 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
IFI35P80217 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFI35P80217 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
IFI35P80217 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFI35P80217 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFI35P80217 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFI35P80217 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFI35P80217 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFI35P80217 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFI35P80217 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFI35P80217 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFI35P80217 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFI35P80217 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFI35P80217 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFI35P80217 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFI35P80217 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFI35P80217 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFI35P80217 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IFI35P80217 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFI35P80217 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFI35P80217 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFI35P80217 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFI35P80217 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFI35P80217 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFI35P80217 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFI35P80217 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFI35P80217 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFI35P80217 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFI35P80217 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFI35P80217 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFI35P80217 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFI35P80217 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFI35P80217 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFI35P80217 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFI35P80217 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFI35P80217 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms