Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRAMEP78395 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAMEP78395 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms