Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLDN10P78369 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN10P78369 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms