Protein–RNA interactions for Protein: P62750

RPL23A, 60S ribosomal protein L23a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23AP62750 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RPL23AP62750 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPL23AP62750 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms