Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFM1P61960 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFM1P61960 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFM1P61960 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFM1P61960 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFM1P61960 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFM1P61960 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFM1P61960 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFM1P61960 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFM1P61960 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFM1P61960 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UFM1P61960 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UFM1P61960 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UFM1P61960 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UFM1P61960 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UFM1P61960 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UFM1P61960 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
UFM1P61960 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UFM1P61960 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
UFM1P61960 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UFM1P61960 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
UFM1P61960 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
UFM1P61960 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFM1P61960 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFM1P61960 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFM1P61960 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFM1P61960 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFM1P61960 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFM1P61960 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFM1P61960 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFM1P61960 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFM1P61960 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
UFM1P61960 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFM1P61960 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFM1P61960 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFM1P61960 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFM1P61960 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFM1P61960 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFM1P61960 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFM1P61960 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UFM1P61960 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UFM1P61960 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UFM1P61960 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UFM1P61960 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UFM1P61960 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UFM1P61960 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UFM1P61960 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UFM1P61960 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UFM1P61960 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UFM1P61960 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UFM1P61960 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UFM1P61960 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UFM1P61960 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UFM1P61960 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UFM1P61960 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UFM1P61960 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UFM1P61960 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UFM1P61960 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UFM1P61960 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UFM1P61960 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UFM1P61960 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFM1P61960 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFM1P61960 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFM1P61960 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFM1P61960 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFM1P61960 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFM1P61960 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFM1P61960 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFM1P61960 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UFM1P61960 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms