Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ERVK-21P61565 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ERVK-21P61565 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms