Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ERVPABLB-1P60509 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ERVPABLB-1P60509 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms