Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNQ4P56696 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNQ4P56696 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNQ4P56696 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms