Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME5P56597 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NME5P56597 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME5P56597 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME5P56597 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME5P56597 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NME5P56597 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME5P56597 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME5P56597 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME5P56597 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME5P56597 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME5P56597 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME5P56597 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NME5P56597 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME5P56597 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME5P56597 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME5P56597 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME5P56597 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME5P56597 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME5P56597 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME5P56597 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME5P56597 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME5P56597 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME5P56597 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME5P56597 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NME5P56597 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NME5P56597 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NME5P56597 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME5P56597 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME5P56597 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME5P56597 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME5P56597 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME5P56597 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME5P56597 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME5P56597 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME5P56597 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME5P56597 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME5P56597 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NME5P56597 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME5P56597 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME5P56597 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME5P56597 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NME5P56597 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME5P56597 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NME5P56597 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME5P56597 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME5P56597 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME5P56597 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME5P56597 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME5P56597 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME5P56597 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME5P56597 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME5P56597 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME5P56597 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME5P56597 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NME5P56597 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NME5P56597 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NME5P56597 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NME5P56597 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NME5P56597 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME5P56597 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME5P56597 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NME5P56597 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NME5P56597 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME5P56597 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NME5P56597 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NME5P56597 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms