Protein–RNA interactions for Protein: P56559

ARL4C, ADP-ribosylation factor-like protein 4C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4CP56559 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARL4CP56559 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARL4CP56559 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4CP56559 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4CP56559 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARL4CP56559 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms