Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ITGA1P56199 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA1P56199 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms