Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAP1L1P55209 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NAP1L1P55209 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms