Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC12A2P55011 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC12A2P55011 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms