Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAD23AP54725 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms