Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RARSP54136 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARSP54136 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARSP54136 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARSP54136 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARSP54136 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARSP54136 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARSP54136 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARSP54136 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARSP54136 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RARSP54136 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARSP54136 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARSP54136 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARSP54136 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RARSP54136 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARSP54136 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RARSP54136 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARSP54136 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARSP54136 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARSP54136 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARSP54136 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARSP54136 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARSP54136 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARSP54136 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARSP54136 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARSP54136 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RARSP54136 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
RARSP54136 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RARSP54136 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RARSP54136 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RARSP54136 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RARSP54136 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RARSP54136 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RARSP54136 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RARSP54136 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RARSP54136 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RARSP54136 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RARSP54136 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RARSP54136 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RARSP54136 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RARSP54136 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARSP54136 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARSP54136 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARSP54136 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RARSP54136 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARSP54136 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARSP54136 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARSP54136 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARSP54136 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARSP54136 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARSP54136 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARSP54136 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RARSP54136 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARSP54136 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARSP54136 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RARSP54136 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARSP54136 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RARSP54136 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARSP54136 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARSP54136 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARSP54136 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARSP54136 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARSP54136 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARSP54136 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARSP54136 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARSP54136 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARSP54136 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RARSP54136 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARSP54136 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARSP54136 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RARSP54136 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms