Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CRISP1P54107 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRISP1P54107 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms