Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNP53814 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNP53814 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNP53814 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNP53814 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNP53814 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNP53814 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNP53814 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNP53814 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNP53814 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNP53814 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNP53814 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMTNP53814 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNP53814 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNP53814 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNP53814 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNP53814 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNP53814 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNP53814 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNP53814 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNP53814 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMTNP53814 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMTNP53814 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNP53814 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNP53814 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNP53814 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNP53814 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNP53814 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNP53814 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNP53814 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNP53814 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNP53814 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMTNP53814 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNP53814 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNP53814 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNP53814 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNP53814 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNP53814 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNP53814 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNP53814 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNP53814 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNP53814 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMTNP53814 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNP53814 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNP53814 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNP53814 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNP53814 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNP53814 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNP53814 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNP53814 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNP53814 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNP53814 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMTNP53814 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMTNP53814 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNP53814 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNP53814 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNP53814 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNP53814 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNP53814 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMTNP53814 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNP53814 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNP53814 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNP53814 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNP53814 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNP53814 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNP53814 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNP53814 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNP53814 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNP53814 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNP53814 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNP53814 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNP53814 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMTNP53814 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMTNP53814 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMTNP53814 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SMTNP53814 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMTNP53814 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMTNP53814 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMTNP53814 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMTNP53814 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms