Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
AP2S1P53680 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
AP2S1P53680 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms