Protein–RNA interactions for Protein: P53599

SSK2, MAP kinase kinase kinase SSK2, yeastyeast

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Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSK2P53599 HOM3YER052C 1584 nt5.5□□□□□ -1.53
SSK2P53599 APC11YDL008W 498 nt5.5□□□□□ -1.53
SSK2P53599 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt5.49□□□□□ -1.53
SSK2P53599 NKP1YDR383C 717 nt5.49□□□□□ -1.53
SSK2P53599 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt5.49□□□□□ -1.53
SSK2P53599 NIP7YPL211W 546 nt5.49□□□□□ -1.53
SSK2P53599 SUE1YPR151C 621 nt5.49□□□□□ -1.53
SSK2P53599 BUB1YGR188C 3066 nt5.48□□□□□ -1.53
SSK2P53599 MRH1YDR033W 963 nt5.48□□□□□ -1.53
SSK2P53599 YTA6YPL074W 2265 nt5.48□□□□□ -1.53
SSK2P53599 SHO1YER118C 1104 nt5.47□□□□□ -1.53
SSK2P53599 YFL052WYFL052W 1398 nt5.46□□□□□ -1.53
SSK2P53599 COS8YHL048W 1146 nt5.46□□□□□ -1.53
SSK2P53599 YKL050CYKL050C 2769 nt5.46□□□□□ -1.53
SSK2P53599 RAI1YGL246C 1164 nt5.46□□□□□ -1.54
SSK2P53599 YGR053CYGR053C 852 nt5.46□□□□□ -1.54
SSK2P53599 YJL175WYJL175W 513 nt5.46□□□□□ -1.54
SSK2P53599 MRPL16YBL038W 699 nt5.46□□□□□ -1.54
SSK2P53599 GAC1YOR178C 2382 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK2P53599 ELM1YKL048C 1923 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK2P53599 CDC26YFR036W 375 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK2P53599 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK2P53599 NAT3YPR131C 588 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK2P53599 OMS1YDR316W 1416 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK2P53599 MEC3YLR288C 1425 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK2P53599 RAD53YPL153C 2466 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK2P53599 NOP7YGR103W 1818 nt5.45□□□□□ -1.54
SSK2P53599 PAN5YHR063C 1140 nt5.44□□□□□ -1.54
SSK2P53599 VBA2YBR293W 1425 nt5.44□□□□□ -1.54
SSK2P53599 YML020WYML020W 1995 nt5.44□□□□□ -1.54
SSK2P53599 YMR317WYMR317W 3423 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK2P53599 YPT7YML001W 627 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK2P53599 MED7YOL135C 669 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK2P53599 MED4YOR174W 855 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK2P53599 NHX1YDR456W 1902 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK2P53599 VMA1YDL185W 3216 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK2P53599 SRO7YPR032W 3102 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK2P53599 DNA2YHR164C 4569 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK2P53599 AIM17YHL021C 1398 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK2P53599 VID28YIL017C 2766 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK2P53599 ATG11YPR049C 3537 nt5.43□□□□□ -1.54
SSK2P53599 RPL34AYER056C-A 366 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK2P53599 YLR156WYLR156W 345 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK2P53599 YLR159WYLR159W 345 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK2P53599 YLR161WYLR161W 345 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK2P53599 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK2P53599 GPI12YMR281W 915 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK2P53599 PAP1YKR002W 1707 nt5.42□□□□□ -1.54
SSK2P53599 PMC1YGL006W 3522 nt5.41□□□□□ -1.54
SSK2P53599 YIL054WYIL054W 318 nt5.41□□□□□ -1.54
SSK2P53599 MAK16YAL025C 921 nt5.41□□□□□ -1.54
SSK2P53599 COX14YML129C 213 nt5.41□□□□□ -1.54
SSK2P53599 SGT1YOR057W 1188 nt5.41□□□□□ -1.54
SSK2P53599 MDR1YGR100W 2853 nt5.41□□□□□ -1.54
SSK2P53599 SNF2YOR290C 5112 nt5.4□□□□□ -1.54
SSK2P53599 BMH2YDR099W 822 nt5.4□□□□□ -1.55
SSK2P53599 NAM2YLR382C 2685 nt5.4□□□□□ -1.55
SSK2P53599 UBA2YDR390C 1911 nt5.39□□□□□ -1.55
SSK2P53599 MDM12YOL009C 816 nt5.39□□□□□ -1.55
SSK2P53599 CHL4YDR254W 1377 nt5.39□□□□□ -1.55
SSK2P53599 MRPL11YDL202W 750 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 MLH2YLR035C 2088 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 NOP4YPL043W 2058 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 RPS8BYER102W 603 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 MRP13YGR084C 1020 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 HGH1YGR187C 1185 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 RPS8AYBL072C 603 nt5.38□□□□□ -1.55
SSK2P53599 NOC2YOR206W 2133 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK2P53599 GSC2YGR032W 5688 nt5.37□□□□□ -1.55
SSK2P53599 YHR202WYHR202W 1809 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK2P53599 RPL8BYLL045C 771 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK2P53599 snR42snR42 351 nt5.36□□□□□ -1.55
SSK2P53599 YLH47YPR125W 1365 nt5.35□□□□□ -1.55
SSK2P53599 HAT2YEL056W 1206 nt5.35□□□□□ -1.55
SSK2P53599 NUP60YAR002W 1620 nt5.35□□□□□ -1.55
SSK2P53599 NMA111YNL123W 2994 nt5.35□□□□□ -1.55
SSK2P53599 SFI1YLL003W 2841 nt5.35□□□□□ -1.55
SSK2P53599 GOT1YMR292W 417 nt5.34□□□□□ -1.55
SSK2P53599 PCA1YBR295W 3651 nt5.34□□□□□ -1.55
SSK2P53599 YHL026CYHL026C 948 nt5.33□□□□□ -1.56
SSK2P53599 YNL320WYNL320W 855 nt5.33□□□□□ -1.56
SSK2P53599 INO80YGL150C 4470 nt5.33□□□□□ -1.56
SSK2P53599 YGR125WYGR125W 3111 nt5.33□□□□□ -1.56
SSK2P53599 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt5.33□□□□□ -1.56
SSK2P53599 SOP4YJL192C 705 nt5.33□□□□□ -1.56
SSK2P53599 TPM1YNL079C 600 nt5.33□□□□□ -1.56
SSK2P53599 PRP40YKL012W 1752 nt5.32□□□□□ -1.56
SSK2P53599 TEM1YML064C 738 nt5.32□□□□□ -1.56
SSK2P53599 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt5.32□□□□□ -1.56
SSK2P53599 TAF7YMR227C 1773 nt5.31□□□□□ -1.56
SSK2P53599 SET5YHR207C 1581 nt5.31□□□□□ -1.56
SSK2P53599 TRP4YDR354W 1143 nt5.31□□□□□ -1.56
SSK2P53599 PEA2YER149C 1263 nt5.31□□□□□ -1.56
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