Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ARFIP2P53365 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ARFIP2P53365 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ARFIP2P53365 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms