Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NKX2-5P52952 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NKX2-5P52952 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms