Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF143P52747 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF143P52747 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms