Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA2P51531 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA2P51531 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA2P51531 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA2P51531 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA2P51531 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA2P51531 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA2P51531 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA2P51531 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA2P51531 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
SMARCA2P51531 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA2P51531 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA2P51531 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA2P51531 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA2P51531 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA2P51531 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SMARCA2P51531 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SMARCA2P51531 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SMARCA2P51531 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
SMARCA2P51531 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SMARCA2P51531 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SMARCA2P51531 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SMARCA2P51531 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.03■■■■■ 4
SMARCA2P51531 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
SMARCA2P51531 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
SMARCA2P51531 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC40.03■■■■■ 4
SMARCA2P51531 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
SMARCA2P51531 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
SMARCA2P51531 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA2P51531 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA2P51531 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA2P51531 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA2P51531 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA2P51531 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA2P51531 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SMARCA2P51531 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SMARCA2P51531 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
SMARCA2P51531 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
SMARCA2P51531 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC40.01■■■■■ 4
SMARCA2P51531 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SMARCA2P51531 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SMARCA2P51531 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
SMARCA2P51531 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC40■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC39.98■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
SMARCA2P51531 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC39.94■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
SMARCA2P51531 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms