Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8P50990 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCT8P50990 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCT8P50990 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8P50990 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8P50990 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8P50990 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8P50990 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8P50990 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8P50990 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8P50990 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCT8P50990 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCT8P50990 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8P50990 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8P50990 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8P50990 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8P50990 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCT8P50990 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8P50990 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8P50990 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8P50990 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8P50990 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8P50990 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8P50990 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8P50990 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8P50990 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8P50990 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8P50990 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8P50990 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8P50990 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8P50990 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8P50990 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8P50990 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8P50990 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8P50990 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8P50990 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8P50990 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8P50990 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8P50990 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8P50990 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8P50990 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCT8P50990 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCT8P50990 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms