Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ERFP50548 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERFP50548 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERFP50548 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ERFP50548 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERFP50548 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERFP50548 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERFP50548 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ERFP50548 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERFP50548 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ERFP50548 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ERFP50548 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERFP50548 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ERFP50548 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERFP50548 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERFP50548 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERFP50548 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERFP50548 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERFP50548 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ERFP50548 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ERFP50548 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERFP50548 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ERFP50548 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERFP50548 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ERFP50548 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ERFP50548 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERFP50548 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ERFP50548 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ERFP50548 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERFP50548 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERFP50548 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERFP50548 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ERFP50548 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERFP50548 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERFP50548 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERFP50548 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ERFP50548 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ERFP50548 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERFP50548 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERFP50548 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERFP50548 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERFP50548 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERFP50548 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERFP50548 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERFP50548 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ERFP50548 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ERFP50548 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ERFP50548 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERFP50548 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERFP50548 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERFP50548 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERFP50548 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERFP50548 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERFP50548 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ERFP50548 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ERFP50548 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms