Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PEX5P50542 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PEX5P50542 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PEX5P50542 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PEX5P50542 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX5P50542 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX5P50542 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX5P50542 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX5P50542 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX5P50542 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PEX5P50542 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX5P50542 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX5P50542 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX5P50542 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX5P50542 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX5P50542 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX5P50542 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX5P50542 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX5P50542 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX5P50542 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PEX5P50542 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX5P50542 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX5P50542 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX5P50542 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX5P50542 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX5P50542 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX5P50542 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX5P50542 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX5P50542 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PEX5P50542 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PEX5P50542 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PEX5P50542 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX5P50542 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX5P50542 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX5P50542 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX5P50542 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX5P50542 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX5P50542 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX5P50542 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX5P50542 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX5P50542 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PEX5P50542 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PEX5P50542 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms