Protein–RNA interactions for Protein: P49917

LIG4, DNA ligase 4, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG4P49917 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LIG4P49917 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIG4P49917 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIG4P49917 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LIG4P49917 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIG4P49917 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIG4P49917 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIG4P49917 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIG4P49917 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIG4P49917 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIG4P49917 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIG4P49917 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LIG4P49917 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LIG4P49917 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIG4P49917 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIG4P49917 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIG4P49917 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIG4P49917 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LIG4P49917 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIG4P49917 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIG4P49917 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIG4P49917 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LIG4P49917 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIG4P49917 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIG4P49917 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIG4P49917 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIG4P49917 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIG4P49917 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIG4P49917 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIG4P49917 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LIG4P49917 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIG4P49917 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIG4P49917 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIG4P49917 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIG4P49917 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LIG4P49917 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LIG4P49917 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LIG4P49917 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIG4P49917 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIG4P49917 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIG4P49917 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIG4P49917 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIG4P49917 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIG4P49917 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIG4P49917 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LIG4P49917 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LIG4P49917 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LIG4P49917 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIG4P49917 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LIG4P49917 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIG4P49917 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIG4P49917 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIG4P49917 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIG4P49917 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIG4P49917 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIG4P49917 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIG4P49917 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LIG4P49917 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIG4P49917 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIG4P49917 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIG4P49917 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIG4P49917 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LIG4P49917 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LIG4P49917 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LIG4P49917 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LIG4P49917 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LIG4P49917 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIG4P49917 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIG4P49917 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LIG4P49917 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LIG4P49917 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms