Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
VEGFBP49765 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VEGFBP49765 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms