Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPIAP49247 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPIAP49247 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPIAP49247 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPIAP49247 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPIAP49247 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPIAP49247 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPIAP49247 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPIAP49247 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPIAP49247 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPIAP49247 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPIAP49247 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPIAP49247 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPIAP49247 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPIAP49247 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPIAP49247 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPIAP49247 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPIAP49247 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPIAP49247 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPIAP49247 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPIAP49247 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPIAP49247 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPIAP49247 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPIAP49247 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPIAP49247 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPIAP49247 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPIAP49247 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPIAP49247 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPIAP49247 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPIAP49247 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPIAP49247 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPIAP49247 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPIAP49247 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPIAP49247 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPIAP49247 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPIAP49247 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPIAP49247 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPIAP49247 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPIAP49247 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPIAP49247 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms