Protein–RNA interactions for Protein: P47895

ALDH1A3, Aldehyde dehydrogenase family 1 member A3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A3P47895 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ALDH1A3P47895 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ALDH1A3P47895 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ALDH1A3P47895 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms