Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GABRB2P47870 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GABRB2P47870 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms